Володимир народився 21 грудня 1980 року в місті Суми. Навчався у школі №12. Із початком повномасштабного вторгнення у лютому 2022 року добровільно став на захист Батьківщини.
У квітні 2023 року приєднався до Сил спеціальних операцій ЗСУ, де проходив службу на посаді старшого оператора у військовому званні старшого солдата.
З вересня по грудень 2023 року Володимир брав участь у контрнаступальних діях у Запорізькій області. Під час виконання штурмових завдань отримав множинні вогнепальні осколкові поранення, однак, незважаючи на це, продовжив виконувати бойове завдання. Після лікування він повернувся до строю.
У квітні 2024 року у складі групи спеціального призначення був направлений до Сумської області для виконання завдань із протидії можливим наступальним діям противника. У грудні 2024 року виконував бойові завдання із забезпечення оборони міста Суми та Сумської області.
Володимир Щербаченко був нагороджений орденом «За мужність» та відзнакою Президента України «За оборону України». Йому було присвоєно звання Почесного громадянина Сумщини (посмертно).
19 серпня 2025 року під час виконання бойового завдання Володимир, рятуючи свого командира групи, потрапив під артилерійський обстріл противника та отримав поранення, несумісні з життям.
Вічна пам‘ять Героєві! Слава Захисникам і Захисницям України!